Glycobiologie moléculaire et structurale

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La thématique principale de l'équipe porte sur l'étude des relations structure-fonction des molécules glucidiques complexes (oligosaccharides et polysaccharides) libres ou associées aux glycoconjugués, et des protéines qui interagissent avec ces molécules glucidiques, principalement les glycosyltransférases (les enzymes qui assemblent les structures glucidiques) et les lectines (les protéines qui les reconnaissent). Cette activité de recherche est menée selon deux axes principaux :

  1. Biosynthèse et reconnaissance des glucides complexes
  2. Analyse structurale d'oligo- et polysaccharides

L'équipe s'intéresse également à l'élaboration de nano-objets de nature glucidique, ainsi qu'au développement d'outils et de bases de données utiles à la communauté des chercheurs oeuvrant dans le domaine des Glycosciences. Son activité se situe à l'interface chimie-biologie avec des compétences allant de la biologie moléculaire, biochimie et enzymologie, cristallographie des protéines aux rayons X et aux méthodes de bioinformatique et de modélisation moléculaire. L'équipe a également à cœur d'aller jusqu'au développement de molécules d'intérêt diagnostique et thérapeutique.

Depuis 2005, l'équipe a résolu  la structure d'une vingtaine de  lectines d'origine variée: bactérienne, plante, fongique ou d'amibe sous forme native ou en complexe avec des ligand représentant une cinquantaine de structures déposées auprès de la Protein Data Bank. Joana Rocha a récemment résolu la structure de la fucosyl transférase FUT1 et la galactosyl transférase MGD1 d'Arabidopsis thaliana qui ont fait l'objet d'une publication dans Plant Cell et the Plant Journal respectivement.

Publications

X-ray crystallography and molecular dynamics revealed that Lewis X blood group antigen  does not always adopt the rigid closed conformation observed in solution when bound to certain lectins.

The CBM40 from NanI from Clostridium Perfringens presents a high affinity for Sialic acid with a Kd for α(2,3)-sialyl-lactose of ∼30 μM

Structure of the  fucosyltransferase FUT1 from Arabidopsis thaliana in complex with xyloglucan at 2.2 angstrom resolution